甘草叶紫堇，多年生草本，高10-20厘米。
须根多数成簇，棒状增粗，长达7厘米，末端骤然变狭成丝状，具少数纤维状细根，干时黄褐色，里面白色。
茎单1，不分枝，上部具叶，下部裸露，基部变细。
基生叶未见；
茎生叶2枚，于茎上部邻接互生，近无柄，叶片厚，轮廓长圆形，长6-7厘米，宽2.5-3厘米，二回羽状分裂，第一回全裂片互生，下部裂片具短柄，3全裂或深裂，中裂片大，椭圆形，侧裂片小，狭椭圆形，上部裂片无柄，椭圆形，不分裂，先端宽楔形或圆形，略尖。
总状花序顶生，长3-5厘米，密集多花；
苞片下部者宽卵形，羽状5-7深裂，上部者狭菱形，扇状深裂，裂片均为条形，无毛或有时背面被白色糙毛，边缘具软骨质缘毛；
花梗短于苞片。
萼片鳞片状，近半圆形，白色微带蓝灰色，膜质，具撕裂状齿；
花瓣紫色（稀白色），上花瓣长2-2.5厘米，花瓣片舟状卵形，先端钝，背部鸡冠状突起高约2.5毫米，自花瓣片先端稍后或有时自先端开始，至距逐渐变矮，离距末1/3处完全消失，有时在花瓣片中部就消失，瓣片边缘具粗糙稀疏的锯齿，距圆筒形．与花瓣片近等长，自中部向下直角弯曲，下花瓣舟状长圆形，长约1.5厘米，花瓣片宽倒卵形，边缘开展，具细圆齿状锯齿，背部鸡冠状突起高，中部缢缩，下部呈囊状，内花瓣提琴形，长1.1-1.2厘米，花瓣片长圆形，背部鸡冠状突起延伸至爪，具1侧生囊，基部2耳垂，爪楔状条形，略长于花瓣片；
雄蕊束长约1厘米，花药极小，淡黄色，花丝披针形，蜜腺体贯穿距的1/2；
子房灰绿色，狭椭圆形，长约5毫米，花柱稍短于子房，柱头绿色，双卵形，具8个乳突。
蒴果（未成熟）宽椭圆形，有6-8枚种子。
种子近三角形至圆形。
花果期6-9月。
