密穗黄堇，无毛草本，高20-40厘米。
须根多数成簇，棒状增粗或纺锤状增粗，具长柄，长2-7厘米，粗0.2-0.5厘米，干时褐色，里面白色。
茎1-4条，上部具叶，不分枝或具1-4分枝，下部裸露，基部线形。
基生叶1-5枚，叶柄细弱，长6-8（-20）厘米，叶片轮廓宽卵形至近圆形，二至三回羽状分裂，末回裂片狭椭圆形至狭披针形，长1-1.5厘米，先端钝，表面绿色，背面具白粉；
茎生叶1-5枚，互生于茎上部或稍下，下部叶具长达3厘米的柄，上部叶具极短柄或近无柄，叶片轮廓宽卵形或三角形，其他同基生叶，但下部叶比基生叶大，向上渐小。
总状花序1-5，生于茎及分枝顶端，长3-8厘米，有15-50花，排列密集；
苞片下部者同上部茎生叶，中部者羽状分裂，裂片条形，最上部者狭披针形，全缘或缺刻；
花梗与苞片近等长。
萼片小，白色，膜质，近圆形，边缘流苏状；
花瓣黄色，上花瓣长1.8-2厘米，花瓣片卵形，背部鸡冠状突起高约1.5毫米，自瓣片先端开始至其末端消失，距圆筒形，长1.2-1.3厘米，约占上花瓣长的2/3，末端略下弯，下花瓣倒卵形，长0.8-0.9厘米，背部鸡冠状突起高约1.5毫米，内花瓣提琴形，长0.6-0.7厘米，花瓣片先端圆，具1侧生囊，爪长约2.5毫米，向下渐狭；
雄蕊束长约0.6厘米，花丝披针形，花药极小，长圆形，蜜腺体贯穿距的2/5；
子房椭圆形，长0.2-0.3厘米，胚珠数枚，排成2列，花柱细，长0.3-0.4厘米，柱头双卵形，上部具2乳突。
蒴果椭圆形，长约1厘米，粗约0.3厘米，成熟时自果梗基部反折。
种子近圆形，直径约1.5毫米，黑色，略具光泽。
花果期6-8月。
