藏中黄堇，多年生草本。
根茎密被亮黄色的鳞片和叶残基。
茎长10-20厘米，不分枝，近基具1对对生的小叶（有时退化成鞘状的鳞片）。
基生叶长5-10厘米；
叶片长圆形，长3-5厘米，具3-4对羽片；
羽片卵圆形，近羽状分裂至深裂成3-7枚的裂片；
裂片长5-8毫米，宽2-3毫米，极尖至短渐尖。
总状花序疏具6-16花。
苞片披针形，全缘，长5-13毫米，宽1-2.5毫米，上部的渐变小。
花梗纤细，长1.1-2（-2.5）厘米，果期可能下弯。
萼片小。
花冠污黄色。
外花瓣渐尖，具较宽的鸡冠状突起。
上花瓣长约1.1厘米；
距较狭短，长3-4毫米；
蜜腺体细，约贯穿距长的1/2。
内花瓣长约6毫米。
子房椭圆形，具长2-2.5毫米的花柱；
柱头四方形，顶端具4明显的顶生乳突，侧面近边缘具2侧生的并生乳突，基部下延，基部具并生乳突。
