贡山金腰，多年生草本，高（3.5-）8.4-22.8厘米。
茎仅于近叶腋部生有褐色柔毛和乳头突起，他处则无毛。
基生叶具长柄，叶片肾形，长（1.4-）3-5.2厘米，宽（1.7-）3-7厘米，边缘具15-26浅齿（齿先端多少凹陷），腹面无毛，背面和齿间疏生褐色乳头突起和柔毛，叶柄长(2.3-）9-13厘米；
茎生叶1枚，叶片肾形，长（1.1-）2-3.4厘米，宽（1.5-）4.1-5.2厘米，边缘具22-29浅齿（齿多数不叠接，其先端多少凹陷），腹面无毛，背面和齿间疏生褐色乳头突起，叶柄长0.6-9厘米，疏生褐色乳头突起。
聚伞花序长3.3-4.3厘米；
苞叶肾形至扇形，长0.7-2.8厘米，宽0.8-3.5厘米，边缘具5-15浅齿（齿先端凹陷），腹面无毛，背面疏生褐色柔毛，齿间具褐色乳头突起和柔毛；
花梗长0.3-4毫米；
萼片在花期近开展，多少相叠接，扁圆形，长约2.1毫米，宽2-3毫米，先端钝圆；
雄蕊短于萼片，花丝长约0.9毫米；
子房半下位，花柱长约0.3毫米，叉开。
蒴果长约3毫米，先端近平截而微凹，喙长约0.4毫米；
种子棕褐色，卵球形，长0.9-1毫米，光滑无毛，有光泽。
花果期5-10月。
