小叶马蹄香，多年生草本；
根状茎短，根稍肉质，直径1-2毫米。
叶心形、卵心形、稀近戟形，长3-6厘米，宽3.5-7.5厘米，先端急尖或钝，基部心形，两侧裂片长2-4厘米，宽2.5-6厘米，叶面通常深绿色，有时在中脉两旁有白色云斑，在脉上或近边缘处有短毛，叶背浅绿色，或初呈紫色而逐渐消退，或紫色，无毛；
叶柄长3-15厘米；
芽苞叶卵形或长卵形，长约10毫米，宽7毫米，边缘有睫毛。
花紫色；
花梗长约1厘米，有时向下弯垂；
花被管球状，直径约1厘米，喉部强度缢缩，膜环宽约1毫米，内壁有格状网眼，花被裂片三角卵形，长1-1.4厘米，宽8-10毫米，基部有乳突皱褶区；
药隔伸出，圆形，中央微内凹；
子房近上位，花柱6，柱头卵状，顶生。
花期4-5月。
