毛瓣堇菜，一年生草本，无地上茎，高达7厘米。
根状茎淡褐色，稍粗壮，垂直，长1.5-2.5厘米。
根较粗而长，向下直伸。
叶通常多数，均基生；
叶片上部者披针形，下部者三角状卵形，或长圆状卵形，长3-4.5厘米，宽2-3厘米，先端钝，基部宽心形或楔形，下延于叶柄，边缘疏生圆钝齿，两面无毛，或仅下面沿叶脉有短毛；
叶柄长于或短于叶，上部具狭翅，疏生开展短粗毛或无毛；
托叶褐色，1/2-2/3与叶柄合生，离生部分线状披针形，先端渐尖，全缘或疏生具褐色腺体的细齿。
花淡紫堇色，较小；
花梗长于叶，在中部以下有2枚小苞片；
小苞片线形，全缘，长约7毫米；
萼片披针形，长约5毫米，基部宽约1.5毫米，先端尖，基部附属物短，末端圆钝，全缘或有时具波状圆齿，具3脉，无毛；
花瓣倒卵形，全缘，侧方花瓣密生须毛，上方花瓣亦有少量须毛，下方花瓣连距长约1.2厘米，距短粗，浅囊状，长约1.2-2毫米，粗约2毫米，末端圆；
子房无毛，长圆状，花柱细，棍棒状，基部膝曲，长约1.5毫米，柱头两侧及后方具稍薄而直展缘边，中央部分稍凸起，前方具短喙，喙端具较细的柱头孔。
蒴果长圆形，长1-1.2厘米，先端尖，无毛。
种子卵球形，长约2毫米，粗约1.5毫米，赤褐色。
花果期6-9月。
