毛堇菜植株较健壮，根状茎粗长；叶形较大，先端渐尖，两面常有白色短毛，托叶深褐色；萼的附属物伸长，末端具圆齿；柱头顶端两侧有较宽的缘边。
萼片披针形，长4.5-5.5毫米，宽1.2-1.8毫米，先端尖，基部具较长的附属物，附属物长约2毫米，末端具2-3浅齿，疏生纤毛，具3脉。
花瓣长圆状倒卵形，长约1.5厘米，侧方花瓣里面无须毛，下方花瓣较短，里面有紫堇色条纹，具短距。
花期4-6月，果期7-8月。