云南婆婆纳，多年生草本，株高10-30厘米。
茎上升，细弱，不分枝，有两列或几乎遍布多细胞柔毛。
叶4-5对，几乎均匀分布，中部的叶具长3-7毫米的叶柄，上部的叶柄短得多，叶片下部的小，卵形，基部圆钝，上部的大，长卵形至卵状披针形，长2-3厘米，宽1-1.5厘米，基部圆，顶端急尖至短渐尖，每边具4至多枚深刻而多少弯曲向叶顶的锯齿，两面无毛或上面疏生几根柔毛。
总状花序常2（少1或3)支，侧生于近顶端叶腋，花期长约2厘米，果期伸长可达8厘米，有疏离的花2-10朵，具长0.5-2厘米的总梗，花序轴及花梗相当密地被多细胞腺毛；
苞片条形，长3-4毫米，几乎无毛；
花梗直而短；
花萼裂片长椭圆形或倒披针形，长3毫米，有多细胞腺质硬睫毛；
花冠粉红色，直径11毫米，喉部被毛，前方裂片倒卵形，其他裂片倒卵圆形；
雄蕊比花冠短得多。
蒴果折扇状菱形，基角稍大于120度，上缘有腺质睫毛，长4-5毫米，宽8-10毫米，花柱长3毫米。
种子南瓜子形，长0.6毫米。
花果期6-8月。
