长果水苦荬，一年生草本，通常花序轴、花梗、花萼及蒴果多少被腺毛，少有茎上也有腺毛，有时全体无毛。
茎高15-50厘米，直立，不分枝或基部有分枝。
叶无柄，半抱茎，披针形至条状披针形，长2-5厘米，宽0.5-1厘米，近于全缘或有尖锯齿。
总状花序长可达15厘米；
花梗长3-7毫米，直或上端稍弯曲，与花序轴成60-70度角；
花萼裂片椭圆形，顶端急尖，不明显3条脉，背面常有许多腺毛，果期直立，紧贴蒴果；
花冠直径3毫米，蓝色或淡紫色。
蒴果椭圆形或宽椭圆形，顶端稍微凹，长2.5-4毫米，宽2-2.5毫米，超出花萼，花柱长约1.5毫米。
种子长约0.7毫米。
2n＝18。
