糙果芹，多年生草本，高0.7-1.6米。
主根纺锤形，侧根纤细。
茎直立，有条纹，中空，多分枝，被短糙毛。
基生叶或较下部的茎生叶有柄，柄细弱，被毛；
叶片长3-10厘米，宽2.5-7厘米，1-2回羽状深裂；
裂片呈阔卵形，卵状披针形或近卵状三角形，长1-3.5厘米，宽0.5-2.5厘米，先端渐尖、基部楔形、截形或微心形，边缘有不规则的锯齿或缺刻，两面有糙毛；
较上部的茎生叶略小，裂片呈狭披针形或线状披针形，全缘或有少数裂齿；
最上部的茎生叶极其退化。
复伞形花序顶生或侧生，花序梗长1-4厘米，细弱；
无总苞片和小总苞片；
伞辐3-8，丝状，长1-2厘米；
小伞形花序有花3-8朵，花柄丝状，长于花2-3倍；
萼齿退化；
花瓣白色，倒卵形或倒卵圆形，长0.8-1毫米，宽0.5-0.8毫米，先端微凹而有内折的小舌片，背面疏生糙毛，中脉1条；
花药近圆形，淡黄色；
花柱基圆锥形，花柱短，向外反折。
果实卵圆形或圆心形，长、宽各约1.2毫米，表面有糙毛；
每棱槽内有油管2-3；
胚乳腹面平直；
心皮柄2裂至基部。
花果期7-9月。
