黄芩的花萼开花时长4毫米，果时花萼长5毫米。
黄芩的根对防治棉铃虫、梨象鼻虫、天幕毛虫、苹果巢虫均有效。
根茎肥厚，肉质，径达2厘米，伸长而分枝。
黄芩主要有两种黄芩碱素的衍生物，分别是汉黄芩素（Woogonin，C16H12O5）和黄芩甙（baicalin, C21H18O11）。