黄芩的茎秆可提制芳香油，亦可代茶用，称为芩茶。
黄芩主要有两种黄芩碱素的衍生物，分别是汉黄芩素（Woogonin，C16H12O5）和黄芩甙（baicalin, C21H18O11）。
叶子坚纸质，披针形至线状披针形，长1.5-4.5厘米，宽0.5-1.2厘米。
黄芩的花序在茎及枝上顶生，总状，长7-15厘米，常再于茎顶聚成圆锥花序。