大花玄参的根较茎粗壮，上部粗达12毫米，下部分裂成数条细长支根。
大花玄参的退化雄蕊圆形或多少肾形。
大花玄参的叶柄长可达4厘米。
大花玄参的花冠黄色，长9-15毫米，外面无毛，上唇及其下筒中有长柔毛，上唇显著长于下唇。