南川鼠尾草的叶片卵圆形或披针形，边缘有圆齿或锯齿，薄纸质。
南川鼠尾草的花期是7-8月。
南川鼠尾草的花冠紫红色，长0.9-3厘米，长筒形，二唇形，上唇长圆形，下唇三裂。
南川鼠尾草的根肥厚，狭锥形，长2-6（15）厘米，径3-4毫米。