新疆五针松的花期在5月，球果第二年9-10月成熟。
新疆五针松的树皮是淡褐色或灰褐色，枝条较密，颜色为黄色或淡褐黄色，密被淡黄色长柔毛。
新疆五针松适应性及耐荫性强，能在干燥砂地和排水不良的沼泽地上生长，但在土层深厚、排水良好的砂壤土或粘壤土上生长最好。
新疆五针松可高达35米，胸径达1.8米。