蒴果卵形，扁平，两室很不相等，长约12-16毫米，宽约4-6毫米，顶端渐尖，基部被宿萼所斜包。
多年生草本，干后不变黑色，直立，高约20-40厘米，高者可达70厘米，疏被短柔毛或近于无毛。
叶互生或假对生，基生叶多数常早脱落，茎生下部叶柄长可达5厘米，上部叶柄约5毫米或更短，叶片膜质，长圆状披针形至线状长圆形。
扭旋马先蒿在亲缘上与大卫氏马先蒿最相近，分布区域也主要在甘肃南部与四川北部。