圆筒穗水蜈蚣，多年生草本，根状茎短缩。
稈丛生，较细，高8-32厘米，三稜形，平滑，基部具少数叶。
叶短于稈，宽2.5-4毫米，平张，边缘具细刺。
叶状苞片3枚，有时4枚，平展，或有时向下折；
穗状花序1-3个，无总花梗，密聚；
居中者长圆状圆筒形或长圆形，长6-14毫米，宽4-6毫米，侧生者通常较短，均具极多数密生小穗；
小穗小，卵状椭圆形或卵形，顶端渐尖，稍肿胀，长约2.2毫米，具1-2朵花；
鳞片膜质，宽卵形，凹形，顶端具短尖，长约2毫米，淡绿黄色或微黄白色，背面龙骨状突起上无刺，具多条脉；
雄蕊2，花药线形；
花柱中等长，柱头2。
小坚果椭圆形或倒卵状椭圆形，扁双凸状，初期黄色，成熟后暗棕色，表面具微突起细点。
花果期5-7月。
