冠鳞水蜈蚣，一年生草本，具许多须根。
稈密丛生，柔弱，直立或外倾，高2-20厘米，扁锐三稜形，平滑，基部不膨大。
叶等长或稍短于稈，宽2-3毫米，萎软状；
叶鞘棕紫色，下面的1-2个叶鞘顶端无叶片。
苞片3-4枚，叶状，较长，基部常增宽，平展或向下反折；
穗状花序通常1个，很少2-3个，近于球形，直径6-9毫米，具多数小穗；
小穗密聚，宽卵形，压扁，长2.5-3毫米，宽1.5-2毫米，具1朵花；
鳞片膜质，舟状，长同于小穗，顶端具直的短尖，苍白色或麦稈黄色，有时有锈色斑点，背面龙骨状突起绿色，具翅，翅从基部开始，其全长2/3部分的边缘具6-10个粗齿而呈鸡冠状，齿顶端具1-3条刺状硬毛；
雄蕊2个或1个，花药长圆形；
花柱中等长，柱头2。
小坚果椭圆形，扁，长约为鳞片的2/3，初时黄色，后期呈暗栗色，具密的稍突起细点。
花果期8-10月。