东北扁果草,根状茎长而横走,生多数须根和纺锤状的块根;
块根长4-10毫米,粗1.3-1.7毫米,外皮近黑色。
茎直立,高10-18厘米,无毛。
叶基生,少数,为二回三出复叶,无毛;
叶片轮廓近三角形,宽达6厘米,中央小叶具细柄,近扇形,长8-15毫米,宽15-20毫米,三深裂,深裂片倒卵形,顶端具3个钝圆齿,表面绿色,背面色较淡;
叶柄长5.5-7.5厘米。
花序稀疏,含花2-3朵;
苞片叶状,下部的二回三出,形状似基生叶,最上部的苞片一回三出,小叶三深裂;
花梗纤细,长1.5-6毫米;
萼片5,白色,椭圆形或狭倒卵形,长6.5-7.5毫米,宽3-3.5毫米,顶端钝;
花瓣倒卵状椭圆形,长约3毫米,沿下缘微合生成浅杯状,具长约0.4毫米的短柄,基部浅囊状;
雄蕊20-30,长约5毫米,花药宽椭圆形,长约0.6毫米;
心皮(1-)2,子房狭倒卵形,扁平,长约3毫米,花柱长约2毫米。