独龙凤仙花，多年生草本，根状茎匍匐，具细长须根。
全株无毛。
茎直立或斜升，高15-50厘米，较细，绿色或上部带紫色，不分枝或中部具短枝，下部无叶，上部有近轮生的叶。
叶互生，近无柄或具短柄；
叶片膜质，长圆状卵形或披针形，长4-10厘米，宽1.5-2厘米，顶端长渐尖，基部狭楔形狭成，长约5毫米的叶柄，边缘具密或粗圆齿，齿端具小尖或腺体，齿间具刚毛，侧脉6-8对，上面绿色，特别在脉上具秕糠状糙毛，下面灰绿色，或有时变紫色。
总花梗生于上部叶腋纤细，直立，短于叶，长2-4 (5) 厘米，具1-2花，稀3花；
花梗线状，长10-14毫米，基部有苞片；
苞片膜质，卵状披针形，长3毫米，宿存。
花紫色 (据记载) ，长2-3厘米；
侧生萼片4，外面2枚卵形，长2-3毫米，顶端具小尖，基部极斜，近膜质，内面2枚极小，线形，顶端具腺体；
旗瓣圆形，长5-7毫米，宽5-6毫米，凹，无龙骨状突起；
翼瓣无柄，长14-15毫米，2裂，基部裂片开展，三角状圆形，上部裂片较长，狭披针形，顶端尖，常短2浅裂，背部具小耳；
唇瓣檐部长漏斗形，长15毫米，口部极斜，宽6-7毫米，具长小尖头，基部渐狭成短而细，直立或略弯顶端小球形的距。
花丝线形，长1.5毫米；
花药圆钝。
子房纺锤形；
蒴果线形，长1.5厘米。
种子多数。
花期8-9月，果期10月。
