藏南凤仙花，一年生草本，高30-70厘米，全株无毛。
茎纤细，不分枝或自基部有分枝。
叶膜质，互生，具柄，卵状披针形，长3.5-9厘米，宽1.5-3.5厘米，顶端尖或渐尖，基部宽楔形，边缘具锐锯齿，基部边缘具缘毛而无腺体。
总花梗纤细，单生于叶腋，长10-15毫米，具2或1花；
花梗细，中部有刚毛状苞片；
苞片绿色，宿存。
花长10-15毫米，白色或浅黄色，具红色斑点，侧生萼片2，小，镰刀状；
旗瓣宽椭圆形，中肋背面具狭龙骨状突起，具小尖头；
翼瓣无柄，基部裂片近圆形，上部裂片长圆状，镰刀形；
唇瓣斜舟状，无距。
花药钝。
子房纺锤状，顶端具5齿裂；
蒴果线形，长2-2.5厘米，顶端具5裂。
种子多数，倒卵圆状，具瘤状突起。
花期7-9月。
