异药龙胆，一年生草本，高4-7厘米。
茎坚硬，直立，黄绿色，被细乳突或光滑，自基部起分枝。
基生叶大，在花期枯萎，宿存，宽卵形，长7-10毫米，宽5-8毫米，先端钝圆，有小尖头，边缘软骨质，具乳突，两面光滑，中脉细，在下面明显，叶柄宽，长0.3-0.5毫米；
茎生叶密集，覆瓦状排列，矩圆形、矩圆状、披针形或卵状披针形，长3-9毫米，宽1.5-3.5毫米，先端钝，具短小尖头，边缘膜质，宽，稍作啮蚀形，有细乳突或近平滑，两面光滑，叶脉不明显，叶柄背面具细乳突，连合成长1-1.5毫米的筒。
花多数，单生小枝顶端；
花梗黄绿色，密被细乳突，长2-4毫米，藏于最上部一对叶中；
花萼倒锥状筒形，长7-10毫米，裂片椭圆状披针形，长3-4毫米，先端急尖，具短小尖头，边缘膜质，宽，稍作啮蚀形，平滑，脉不明显，弯缺狭，楔形或截形；
花冠蓝紫色，漏斗形，长13-20毫米，裂片卵圆形，长3.5-4.5毫米，先端钝圆，褶卵形或卵状椭圆形，长2-2.5毫米，先端有不整齐细齿；
雄蕊着生于冠筒中部，不整齐，花丝丝状钻形，长3-6毫米，花药狭矩圆形，长1.5-1.7毫米；
子房椭圆形，长2-2.5毫米，两端渐狭，柄粗，长1-1.5毫米，花柱线形，连柱头长2-3毫米，柱头2裂，裂片线形。
蒴果内藏，矩圆状匙形，长6-7毫米，先端圆形，有宽翅，两侧边缘有狭翅，基部渐狭，柄长至7毫米；
种子红褐色，矩圆形，长1.1-1.3毫米，表面具细网纹。
花果期4-5月。
