甘肃贝母，植株长20-40厘米。
鳞茎由2枚鳞片组成，直径6-13毫米。
叶通常最下面的2枚对生，上面的2-3枚散生，条形，长3-7厘米，宽3-4毫米，先端通常不卷曲。
花通常单朵，少有2朵的，浅黄色，有黑紫色斑点；
叶状苞片1枚，先端稍卷曲或不卷曲；
花被片长2-3厘米，内三片宽6-7毫米，蜜腺窝不很明显；
雄蕊长约为花被片的一半；
花药近基着，花丝具小乳突；
柱头裂片通常很短，长不及1毫米，极个别的长达2毫米（宝兴标本）。
蒴果长约1.3厘米，宽1-1.2厘米，棱上的翅很狭，宽约1毫米。
花期6-7月，果期8月。
