珍珠矮，地生植物，矮小，常单株生长，无假鳞茎，地下有1条近肉质的根状茎；
根状茎扁圆柱形，直径达1厘米以上，有数节，与周围数条肥厚根的色泽相同，不易分辨。
叶2-3枚，带形，直立，长25-30厘米，宽1-1.2厘米，先端近急尖，边缘具细齿，中脉在两面凹陷，侧脉则两面浮凸，无明显关节；
叶鞘常带紫色。
花葶从植株基部发出，直立，长10-13厘米；
总状花序疏生3-4朵花；
花苞片线形或线状披针形，长4-9毫米；
花梗和子房长1.6-2厘米；
花直径2.5-3.2厘米，有香气，黄绿色或淡紫色，萼片与花瓣有5条深色脉纹；
萼片长圆形，长1.3-1.6厘米，宽6-7毫米，先端圆钝并具细尖；
中萼片向前倾，侧萼片多少围抱蕊柱；
花瓣亦为长圆形，长1. 1-1.4厘米，宽6-7毫米，先端亦圆钝；
唇瓣长圆状卵形，长8-10毫米，不明显3裂；
侧裂片上有紫色斜脉纹；
中裂片外弯，亦有紫斑；
唇盘上有2条纵褶片，上半部向内倾斜并靠合；
蕊柱长6-7毫米。
花期6月。
