云南山楂，落叶乔木，高达10米；
树皮黑灰色，枝条开展，通常无刺；
小枝微屈曲，圆柱形，当年生枝紫褐色，无毛或近于无毛，二年生枝暗灰色或灰褐色，散生长圆形皮孔；
冬芽三角卵形，先端急尖，无毛，紫褐色，有数枚外露鳞片。
叶片卵状披针形至卵状椭圆形，稀菱状卵形，长4-8厘米，宽2.5-4.5厘米，先端急尖，基部楔形，边缘有稀疏不整齐圆钝重锯齿，通常不分裂或在不孕枝上少数叶片顶端有不规则的3-5浅裂，幼时上面微被伏贴短柔毛，老时减少，下面中脉及侧脉有长柔毛或近于无毛；
叶柄长1.5-4厘米，无毛；
托叶膜质，线状披针形，长约8毫米，边缘有腺齿，早落。
伞房花序或复伞房花序，直径约4-5厘米；
总花梗和花梗均无毛，花梗长5-10毫米，花直径约1.5厘米；
萼筒钟状，外面无毛；
萼片三角卵形或三角披针形，约与萼筒等长；
花瓣近圆形或倒卵形，长约8毫米，宽约6毫米，白色；
雄蕊20，比花瓣短；
花柱3-5，子房顶端被灰白色绒毛，柱头头状，约与雄蕊等长。
果实扁球形，直径1.5-2厘米，黄色或带红晕，有稀疏褐色斑点；
萼片宿存；
小核5，内面两侧平滑，无凹痕。
花期4-6月，果期8-10月。
