大金紫堇，主根未见。
茎长10-25厘米，地下部分具少数鳞片，地上部分具3-5叶，分枝。
叶具长柄和三小叶，叶柄基部多少鞘状，小叶稍肉质，上面绿色，下面苍白色，宽卵圆形，顶生的长1-3厘米，宽6-18毫米，具短柄，侧生的较小，无柄，全部2-3裂，稀全缘。
总状花序伞房状，具2-6 (-10)花，花序轴不明显（约长5-15毫米）。
苞片披针形，长1-1.5厘米，宽2-6毫米，近总苞状排列。
花梗纤细，长1.5-2厘米，果期长达3-4厘米，弧形下弯。
花紫红色，先直立，后平展，顶端着色较深。
萼片近圆形，长约1-1.5毫米，具齿。
外花瓣具鸡冠状突起，瓣片侧面弧形下凹，十分类似裂瓣紫堇。
上花瓣长1.2-1.5厘米；
距圆筒形，约与瓣片等长，直或末端多少弯曲；
蜜腺体约占距长的2/3，纤细，末端渐尖。
下花瓣稍前伸，直或瓣片下弯，近基缢缩。
内花瓣长7-8毫米，顶端暗紫色。
柱头头状，顶生4乳突。
蒴果卵圆形，长5-8毫米，宽约3毫米，具3-5种子和长3-4毫米的花柱，自弯曲的果梗顶端反折。
