匍枝柴胡，多年生小草本，略匍伏，有较长的根茎。
茎多数斜伸，自基部分枝，稀疏丛生，高10-14厘米，带紫红色。
基生叶线形，稀少，常带紫色，长3-5厘米，宽2-3毫米，5-7脉，中部以上的茎生叶披针形到狭卵形，顶端渐尖，有时有短尾，叶片中部以下扩大至基部再变狭抱茎，无柄，长1.5-3厘米，宽5-8毫米，7-11脉。
复伞形花序很少，顶生；
总苞片1-3，卵圆形，不等大，长5-10毫米，宽4-7毫米，顶端渐尖或钝，有小突尖头，基部渐狭，7-9脉；
伞辐2-4，不等长，长1-2厘米；
小伞直径11-13毫米；
小总苞片6-10，常带紫色，广卵形，顶端急尖，有小突尖头，基部渐窄，长6-8毫米，宽3.5-5.5毫米，5-7脉，略长过花期的小伞形花序；
小伞形花序有花16-24，花柄长1-2毫米；
花瓣紫色，中肋突出，舌片梯形；
花柱基暗紫色。
果实长圆形，棕色，果棱狭翼状；
棱槽中油管3，合生面4。
花期7-8月，果期8-9月。
