黑果小檗，常绿灌木，高1-2米。
枝棕灰色或棕黑色，具条棱或槽，散生黑色疣点；
茎刺三分叉，长1-4厘米，淡黄色，腹面扁平。
叶厚纸质，披针形或长圆状椭圆形，长3-7厘米，宽7-14毫米，先端急尖，基部楔形，上面深绿色，有光泽，中脉凹陷，背面淡绿色，中脉明显隆起，两面侧脉和网脉微显，不被白粉；
叶缘平展或微向背面反卷，每边具5-10刺齿，偶有近全缘；
具短柄。
花3-10朵簇生；
花梗长5-10毫米，光滑无毛，带红色；
花黄色；
萼片2轮，外萼片长圆状倒卵形，长约4毫米，宽约2毫米，内萼片倒卵形，长约7毫米，宽约4毫米；
花瓣倒卵形，长约6毫米，宽约4.5毫米，先端圆形，深锐裂，基部楔形，具2枚分离腺体；
雄蕊长约4毫米；
胚珠2枚，无柄或具短柄。
浆果黑色，卵状，长约5毫米，直径约4毫米，顶端具明显宿存花柱，不被白粉。
花期4月，果期5-8月。
