贡山秋海棠，多年生草本。
根状茎斜出，扭曲，呈结节状，长3-6.5 (-10)厘米，直径6-10(-15）厘米，具残存褐色的鳞片和多数细长纤维状之根。
茎高可达90厘米，有棱，无毛或近无毛。
基生叶未见，茎生叶互生，具长柄；
叶片两侧极不相等，轮廓镰刀状或长披针形，8-14厘米，宽2.5-3.8厘米，先端长渐尖或长尾尖，基部极偏斜，窄侧楔形，宽侧耳状或近圆形，下延部分长1.2-1.4厘米，边缘浅裂或缺刻状，并有浅而疏不等大三角形重锯齿，齿尖常带短芒，干时上面褐绿色，散生短硬毛，下面浅绿色，沿脉被短柔毛，脉明显突起，呈羽状；
叶柄长1.5-3厘米，被柔毛；
托叶膜质，披针形至卵状披针形，长5-8毫米，宽约5毫米，先端渐尖，脱落。
花2-4（-5)朵，粉红色，呈聚伞状，腋生，花序梗长4-5（-6)厘米，首次分枝长约2毫米，二次分枝7-15毫米，花梗长10-15 (-20)厘米，均无毛；
苞片卵形或长圆形，长8-13毫米，宽约5毫米，先端渐尖；
小苞片膜质，披针形，长约6毫米，先端渐尖；
雄花：花被片4，外轮2枚，宽卵形，长约10毫米，宽约9毫米，先端圆，外面常有长柔毛，内轮2枚椭圆形，长约8毫米，宽约4毫米，先端圆；
雄蕊多数，花丝离生，长0.8-1毫米，密集呈球状，花药倒卵形，长约1毫米；
雌花未见。
蒴果下垂，果梗长约2厘米，无毛；
轮廓椭圆形或倒卵长圆形，长约1厘米，直径5-6毫米，无毛，2室，具中轴胎座，每室胎座具2裂片，具不等3翅，一翅特大，似镰刀状，长1.8-2厘米，宽约1.2厘米，顶端圆，下方的边呈弧形，无毛，有明显脉纹，另2翅较小，近等大，呈斜三角形，长5-7毫米；
种子极多数，小，长圆形，淡褐色，光滑。
花期8月开始，果期12月开始。