蓝花黄耆的总状花序生8-10花，稍稀疏，花序轴长2-2.5厘米，果期延伸；总花梗黑紫色，与叶近等长；苞片钻状披针形，长2-4毫米；花梗长1-2毫米，连同花序轴被黑色短柔毛。
光果蓝花黄耆与原变种的主要区别是植株稍矮小，高15-25厘米，叶卵形、长圆形或线形，子房无毛。
蓝花黄耆的羽状复叶有11-19片小叶，长3-11厘米；叶柄长1-3厘米，向上逐渐变短；托叶离生或基部稍合生，披针形，长约3-7毫米，下面无毛或散生白色短柔毛；小叶长圆形或长圆状披针形，长8-22毫米，宽3-8毫米。
蓝花黄耆的模式标本采自四川木里。