花序顶生，萼片长椭圆形，长约5毫米，上部边缘白色；花瓣长椭圆形，长8-9毫米，宽约2.5毫米，基部呈长爪。
匍匐南芥全草药用，具有清热解毒的功能。
匍匐南芥的基生叶簇生，长椭圆形至匙形，长3-7厘米，宽1.5-2.5厘米，顶端钝圆，边缘具疏齿，基部下延成有翅状的狭叶柄，不具裂片。
花期为3月，果期为4月。