锡金堇菜，多年生草本，无地上茎。
根状茎短粗，长2-2.5厘米，粗4-7毫米，节密生，常残存褐色托叶。
匍匐枝长达10余厘米，节间较长，节处生细根。
叶基生；
叶片宽卵形或近圆形，长1.5-5厘米，宽1.5-4厘米，先端钝，基部深心形，边缘密生浅而圆的锯齿，两面无毛或疏生短毛，上面深绿色，下面灰绿色；
叶柄长3-10厘米，无毛；
托叶披针形，长1-1.3厘米，褐色，边缘具长流苏状齿。
花白色或淡紫色；
花梗长于叶，无毛，中部以上有2枚小苞片；
小苞片线形，近对生，边缘疏生细齿；
萼片狭披针形，长5-6毫米，具3脉，无毛，基部附属物末端圆或疏生牙齿；
花瓣长圆状倒卵形，长10-12毫米，宽4-4.5毫米，侧方花瓣里面无须毛，下方花瓣较短，有紫色脉纹，连距长10-12毫米；
距长约2毫米，粗约2.5毫米，稍膨大；
下方雄蕊背部具角状短矩，较花芶稍长，末端钝；
子房圆锥状，无毛，花柱棍棒状，向上渐增粗，柱头顶部平，两侧及后方具较宽展的缘边，前方具明显而直伸的短喙。
蒴果卵球形。
花期4-5月，果期5-6月。
