紫斑蝴蝶草的叶片宽卵形至卵状三角形，长3-5厘米，宽2.5-4厘米，上面疏被白色柔毛，下面以脉上较多，边缘具三角状急尖的粗锯齿，先端略尖，基部突然收狭成宽楔形。
紫斑蝴蝶草的蒴果为圆柱状，两侧扁，具4槽，长9-11毫米，宽2-3毫米。
紫斑蝴蝶草的花果期为7-10月。
紫斑蝴蝶草的萼片为倒卵状纺锤形，长约1.2厘米，宽5-7毫米，果期长达1.8厘米，宽8毫米，具5翅，翅宽彼此不等，其中有2枚较宽，可达2毫米，翅上被缘毛。