腺毛阴行草的根系浅，主根常短缩或不发达，由根颈部及主根上发出多数侧根，纤细，木质，长约5厘米，直径约1-1.5毫米，有的偶达3毫米，散生多数须根。
腺毛阴行草的花序总状，生于茎枝顶端，但有时伸展到植物的中部以下，较稀疏；花成对，苞片叶状，与萼等长或较短，菱状长卵形至卵状披针形，端渐尖，稍稍羽裂或近于全缘，密被细腺毛。
腺毛阴行草的种子多数，长约1-1.5毫米，黄褐色，长卵圆形，种皮疏松透明，其一侧有龙骨状狭翅一条，顶端向外卷曲，此外尚有较短而细的5条，其上均有细密的网纹，在各翅之间更有横纹约10-20条构成网眼。
腺毛阴行草的茎常单条，基部木质化，不分枝，常在中部以上分枝，枝对生，3-5对，较细长柔弱，约以45°角叉分，端常向一侧偏弯，均为圆筒形，中空，上部具明显的稜角，密被褐色细腺毛，节间短，长约1.5-2厘米。