偏花黄芩，多年生草本。
茎直立或上升，有时具匍匐根茎，连花序高8-30厘米，粗1.2-2.5毫米，四棱形，被白色具节长柔毛，基部多少木质化。
叶通常仅有3-4对，初时如莲座状排列，以后由于节间伸长呈交互对生，中部叶最大，坚纸质，椭圆形或宽卵状椭圆形，长4.5-5.5厘米，宽3.8-4.5厘米，下部叶及近花序叶变小，先端圆形或钝，基部心形或圆形，边缘具浅波状圆齿，上面绿色，下面较淡，具橙色腺点，两面均被白色具节糙伏毛，尤以下面沿脉上为甚，侧脉约4对，上面不显著，下面突出，在叶缘内方网结；
叶柄长1-5厘米，中部者最长，扁平，密被白色具节长柔毛。
花对生，于茎顶上排列成背腹向的总状花序；
总状花序长7-15厘米；
花葶状，序轴被具节长柔毛，序梗长1-4.5厘米；
花梗长约2毫米，有具节长柔毛；
苞片小，卵圆形，向花序顶端渐窄，长约4毫米，宽约2毫米，全缘，无柄，被长柔毛及腺点。
花萼长约2.5毫米，密被短柔毛。
花冠淡紫至紫蓝色，长（1.5）-1.8-2.5（3）厘米，基部成曲膝状，向上渐宽，喉部宽达6毫米，外面疏被微柔毛，内面仅下唇及冠筒中部后方被微柔毛余部无毛，冠檐2唇形，上唇盔状，先端微凹，下唇中裂片半圆形，两侧裂片卵圆形。
雄蕊4，二强；
花丝细长，扁平，中部以下被纤毛。
花盘肥厚，倾斜，前方隆起斜上；
子房柄较长或不甚明显。
花柱细长，无毛。
子房光滑。
小坚果未详。
花期3-5月。
