爪瓣虎耳草生长在海拔3200-5644米的林下、高山草甸和高山碎石隙。
爪瓣虎耳草的花期是7月至8月。
爪瓣虎耳草的模式标本采自青海（夏哈日山）。
爪瓣虎耳草自然分布于甘肃南部、青海（海东、海北、黄南、玉树）、四川西部、云南西北部和西藏。