长冠鼠尾草的花冠颜色有红色、淡紫色、紫红色、紫色至紫蓝色，稀为白色。
长冠鼠尾草的根茎匍匐或斜上升，短，近木质，根常增大成块根状，梭形，长1.5-3（5）厘米，粗3-5毫米，外皮朱红色，侧根丝状，多数。
长冠鼠尾草的小坚果长圆形，长约2.5毫米，腹面具稜，顶端圆，淡褐色，稜棕褐色。
紫蓝色、白色