南川鼠尾草有两种变型：原变型 f. nanchuanensis 和居间变型 f. intermedia。
7-8月
紫红色
南川鼠尾草的花冠紫红色，长0.9-3厘米，长筒形，二唇形，上唇长圆形，下唇三裂。