黑花茜草的聚伞花序腋生和顶生，有纤细而长的总梗；小苞片小，狭长圆形或披针形。花绿白色或绿黄色，干后不变黑，花冠辐状，下部1/3合生，裂片5，狭卵形或卵形，长1.6-2毫米，顶端内弯，有时黑紫色。
黑紫色
黑花茜草生于海拔1900-3000米处的干旱石山或松林中。
黑花茜草的根多条簇生，条状，明显肉质，紫红色。