睦南木莲，乔木，高达10米，树皮灰褐色，芽鳞、嫩枝、叶背面、叶柄及托叶痕均被淡红褐色平伏毛。
嫩枝绿色。
叶革质，倒卵形，狭倒卵形，长10-18 (20) 厘米，宽3.5-5 (6.5) 厘米，先端骤狭短尾状，基部楔形，上面无毛；
侧脉每边10-18条；
叶柄长1.5-3厘米，托叶痕半圆形或半椭圆形，为叶柄长的1/10-1/5。
花被片9，3轮，外轮3 (-2) 片质薄，背面带绿色，长圆状椭圆形，长约7.5厘米，宽约3厘米，内两轮肉质，白色而微带黄色，倒卵形，顶端钝尖，基部渐狭长成爪状，内轮轮狭小，雄蕊长6-9毫米，药隔伸出成1.5毫米的钝尖；
雌蕊群圆柱形，长约1.7厘米，宽约1厘米，心皮狭倒卵圆形，长约6毫米，上部露出面有浅纵沟，胚珠具柄，8-10枚，2列。
聚合果卵圆形或长圆形，长5-9厘米，宽约4厘米。
花期2-4月，果期9-10月。
