山麦冬的花药狭矩圆形，长约2毫米；花丝长约2毫米。
山麦冬的花葶通常长25-65厘米。
山麦冬的花被片矩圆形、矩圆状披针形，长4-5毫米，先端钝圆，淡紫色或淡蓝色。
山麦冬的总状花序长6-15(-20)厘米，具多数花，通常2-5朵簇生于苞片腋内。