金丝桃的花直径3-6.5厘米，星状；花瓣金黄色至柠檬黄色，无红晕，开张，三角状倒卵形，长2-3.4厘米，宽1-2厘米。
金丝桃的萼片形状有宽或狭椭圆形、长圆形、披针形或倒披针形。
金丝桃的果实及根供药用，果实可作连翘代用品，根能祛风、止咳、下乳、调经补血，并可治跌打损伤。
金丝桃的种子深红褐色，圆柱形，长约2毫米，有狭的龙骨状突起，有浅的线状网纹至线状蜂窝纹。