长柱金丝桃，灌木，高约1米，直立，有极叉开的长枝和羽状排列的短枝。
茎红色，幼时有2-4纵线棱并且两侧压扁，最后呈圆柱形；
节间长1-3厘米，短于至长于叶；
皮层暗灰色。
叶对生，近无柄或具短柄，柄长达1毫米；
叶片狭长圆形至椭圆形或近圆形，长1-3.1厘米，宽0.6-1.6厘米，先端圆形至略具小尖突，基部楔形至短渐狭，边缘平坦，坚纸质，上面绿色，下面多少密生白霜，主侧脉纤弱，约3对，中脉的分枝不或几不可见，无或稀有很纤弱的第三级脉网，无腹腺体，叶片腺体小点状至很小点状。
花序1花，在短侧枝上顶生；
花梗长8-12毫米；
苞片叶状，宿存。
花直径2.5-4.5(-5)厘米，星状；
花蕾狭卵珠形，先端锐尖。
萼片离生或在基部合生，在花蕾及结果时开张或外弯，线形或稀为椭圆形，等大或近等大，长0.3-0.6厘米，边缘全缘，中脉多少明显，小脉不显著，腺体约4，基部的线形，向顶端呈点状。
花瓣金黄色至橙色，无红晕，开张，倒披针形，长（1.1-）-1.5-2.2（-2.4）厘米，宽0.4-0.8(-1)厘米，长约为萼片2.5-3.5倍，边缘全缘，无腺体，无或几无小尖突。
雄蕊5束，每束约有雄蕊15-25枚。
子房卵珠形，长3-4毫米，宽2-3毫米，通常略具柄；
花柱长1-1.8厘米，长约为子房3.5-6倍，合生几达顶端然后开张；
柱头小。
蒴果卵珠形，长( 0.4-) 0.6-1.2厘米，宽0.4-0.5厘米，通常略具柄。
种子圆柱形，长约1.3毫米，淡棕褐色，有明显的龙骨状突起和细蜂窝纹。
花期5-7月，果期8-9月。
