岷江金丝梅，本种实系金丝梅一群的基本成员，看来蒙自金丝桃一亚种与尖萼金丝桃有密切的亲缘。
本种变异很大，且不易与金丝梅和匙萼金丝桃H. uralum Buch. -Ham. ex D. Don区分开，实际上可以把这一大群植物处理为有5个亚种的1个种，因鉴于过去对该群植物的分类处理，不宜过多变动，较可取的方案是将本种处理为有3个亚种的1个种，其余的仍按原来的作为2个种处理，这样一来本种的蒙自金丝桃亚种分布上在北方通过西南金丝桃原亚种而与金丝梅相连，而在西北方本种则通过眠江金丝桃亚种而与匙萼金丝桃相连。
