二药藻属，浅海生沉水草本。
根茎匍匐，淡黄棕色，纤细而坚韧，单轴分枝，节明显，节生须根数条，粗短。
直立茎短缩，基生鳞片2枚。
茎生叶1-4，互生，呈2列式；
叶鞘稍扁，脱落后在茎上留下环痕，叶耳与叶舌明显；
叶片长短各异，自下而上渐长，全缘，先端常具2至数齿；
叶脉3条，平行，中脉顶端常扩展，或2又状，侧脉边缘生，常不明显。
花雌雄异株，单生茎顶或侧枝顶端，幼时为叶鞘所包裹，后伸出；
雄花具梗，仅由2枚无花丝的雄蕊组成，花药2室，外向纵裂；
花粉线形；
雌花几无梗，由2枚离生心皮组成，花柱略长，柱头不分裂。
果实卵圆形，稍扁，坚硬，具喙，不开裂。
种子1枚，悬垂。
