东北老鹳草的基生叶具长柄，柄长为叶片的2-3倍，密被倒向糙毛，茎生叶柄向上渐短，最上部叶近无柄。
东北老鹳草的聚伞花序顶生，长于叶，总花梗被糙毛和腺毛，每梗具2-3（5）花。
东北老鹳草的萼片卵状椭圆形或长卵形，长7-8毫米，宽约3毫米，外被长糙毛和腺毛；花瓣紫红色，长为萼片的1.5倍，先端圆形、微凹，基部宽楔形，边缘具长糙毛。
东北老鹳草的花期是7-8月，果期是8-9月。