黄管秦艽，多年生草本，高15-35厘米，全株光滑无毛，基部被枯存的纤维状叶鞘包裹。
须根数条，粘结成一个较细瘦、圆柱形的根。
枝少数丛生，斜升，黄绿色或上部带淡紫红色，近圆形。
莲座丛叶披针形或椭圆状披针形，长7-25厘米，宽1.5-3.5厘米，先端渐尖，基部渐狭，边缘微粗糙，叶脉3-7条，在两面均明显，并在下面突起，叶柄宽，长3.5-5厘米，包被于枯存的纤维状叶鞘中；
茎生叶披针形，稀卵状披针形，长3-6厘米，宽0.5-2.2厘米，先端渐尖，稀急尖，基部钝，边缘微粗糙，叶脉1-3条，在两面均明显，并在下面突起，无柄至叶柄长达2厘米，愈向茎上部叶愈小，柄愈短。
花多数，无花梗，簇生枝顶呈头状或腋生作轮状；
花萼长为花冠的1/4，萼筒膜质，黄绿色，长4.5-7毫米，一侧开裂呈佛焰苞状，先端截形或圆形，裂片5个，甚小，不明显或线形，长至1毫米；
花冠黄绿色，具蓝色细条纹或斑点，筒形，长(1.5)1.8-2(2.5)厘米，裂片卵形或卵圆形，长3-3.5毫米，先端钝圆，全缘，褶偏斜，三角形，长1-1.2毫米，先端急尖，全缘；
雄蕊着生于冠筒下部，整齐，花丝线形，长5-7.5毫米，花药狭矩圆形，长2-2.5毫米；
子房无柄，线状椭圆形，9-11毫米，先端渐尖，花柱线形，连柱头长2-2.5毫米，柱头2裂，裂片矩圆形。
蒴果无柄，内藏，狭椭圆形，长13-15毫米，先端钝；
种子褐色，有光泽，狭矩圆形，长1.5-1.6毫米，表面具细网纹。
花果期8-9月。
