毛喉龙胆，一年生草本，高5-10厘米。
茎黄绿色，具乳突，在基部多分枝，枝简单不再分枝或再分枝，铺散，斜上升，基生叶大，在花期枯萎，宿存，近革质，卵状椭圆形或卵圆形，长7-13毫米，宽4-7毫米，先端急尖，具小尖头，边缘软骨质，仅基部疏生短睫毛，其余光滑或疏生乳突，两面光滑，叶脉1-3条，在下面突起，叶柄膜质，光滑，仅连合成长0.5毫米的筒；
茎生叶对折，疏离，短于或长于节间，狭披针形至线状披针形，长3-11毫米，宽1-1.5毫米，愈向茎上部愈长，先端渐尖或钝，具长小尖头，下部叶边缘软骨质，仅基部疏生短睫毛，其余光滑或疏生乳突，中、上部叶愈向茎上部具由基部至先端逐渐增宽和增长的膜质边，疏生睫毛，以及逐渐缩短的软骨质边，光滑或疏生乳突，两面光滑，中脉软骨质，在下面突起，叶柄膜质，背面具乳突，仅连合成长1-1.5毫米的筒。
花多数，单生于小枝顶端；
花梗黄绿色，具乳突，长2-6毫米，藏于最上部叶中；
花萼倒锥状筒形，长7-9毫米，裂片线状披针形，长3.5-5毫米，先端渐尖或钝，具小尖头，下部边缘膜质，疏生短睫毛，其余边缘软骨质，光滑或疏生乳突，两面光滑，中脉在背面呈脊状突起，并向萼筒下延，弯缺楔形；
花冠上部蓝色，下部黄绿色，倒锥状筒形或筒形，长10-14毫米，外面光滑，喉部内面散生小柔毛，裂片卵状椭圆形，长3-4.5毫米，先端钝，全缘或有2-3个细齿，褶卵形，长2-3毫米，先端钝，边缘有细齿或全缘；
雄蕊着生于冠筒中、下部，整齐，花丝线形，长3-4毫米，花药矩圆形，长0.8-1毫米、子房椭圆形，长3-3.5毫米，先端钝，基部渐狭成柄，柄粗，长1.5-2毫米，花柱圆柱形，连柱头长1-1.2毫米，柱头2裂，裂片矩圆形。
蒴果外露，倒卵状矩圆形或矩圆形，长4-5毫米，先端钝圆，具宽翅，两侧边缘具由上至下渐狭的翅，柄粗，长至15毫米；
种子褐色，椭圆形，长0.8-1毫米，表面具致密的细网纹。
花果期6-10月。