昆明龙胆，多年生草本，高3-5厘米。
须根肉质。
主茎直立或平卧呈匍匐状，淡黄褐色，长可达8厘米，有分枝。
花枝多数，丛生，低矮，黄绿色，光滑。
叶大部分基生，呈莲座状，叶片匙形或矩圆状倒披针形，长1-4厘米，宽0.5-1.2厘米，先端钝圆，基部长渐狭，边缘微外卷，光滑，中脉在上面不明显或凹下，在下面稍突起，叶柄长1-3.5厘米，具狭翅；
茎生叶2-3对，与基生叶相似而略小，叶片长8-10毫米，宽2.5-3毫米，叶柄长7-10毫米。
花枝2-8个，由叶腋中抽出，具1-3朵花，花簇生枝端；
无花梗；
花萼狭倒锥形，长1.3-1.5厘米，裂片小，整齐，三角形或钻形，长1-1.5毫米，先端急尖，弯缺圆形或截形；
花冠蔷薇色，冠檐具多数蓝色斑点，漏斗形，长3-4厘米，裂片卵状三角形，长4-5毫米，先端钝，全缘，褶偏斜，卵形，长1.5-2毫米，先端钝，边缘有整齐细齿；
雄蕊着生于冠筒下部，不整齐，花丝线形，长10-14毫米，花药矩圆形，长1-1.3毫米，子房线状椭圆形，长1.2-1.5厘米，两端渐狭，柄长1.2-1.8厘米，花柱线形，连柱头长3-4毫米，柱头2裂，裂片线形。
蒴果内藏，椭圆形，长1.7-2厘米，两端钝，柄长至2厘米；
种子淡黄色，有光泽，矩圆形，长0.8-1毫米，表面具蜂窝状网隙。
花果期4-9月。
