紫斑大戟，一年生草本。
根纤细，长约6厘米，直径约0.8-1.0 毫米。
茎斜展或近直立，极少匍匐，无毛，长约15厘米，直径约1毫米。
叶对生，椭圆形，长1-2厘米，宽3-5毫米，先端钝，基部偏斜，不对称，近圆形，边缘具稀疏钝锯齿；
叶面具数个紫色斑点；
叶柄短，长约1.5毫米；
托叶平截状，极短，先端唇齿状。
花序单一或聚伞状生于叶腋，单生时具柄；
总苞狭钟状，高8毫米，直径4-5毫米，边缘5裂，裂片三角形；
腺体4，黄绿色，边缘具有比腺体宽的白色或粉色附属物。
雄花5-15枚；
雌花1枚。
具较长的子房柄；
子房光滑，无毛；
花柱3，分离；
柱头2浅裂。
蒴果三角状卵形，长与直径均约2.5毫米，光滑无毛；
果柄长达2毫米。
种子卵状四棱形，长约1.1毫米，直径约0.8毫米，每面具3-4横沟，无种阜。
花果期4-10月。
